ちゃんとあるじゃん。 carパッケージにrecodeという関数があった。

って、最近Ｒのメモしか書いてませんが…… wilcox.test(X - Y) と wilcox.test(X, Y, paired=T) は同じ。同様に、 t.test(X - Y) と t.test(X, Y, paired=T) は同じ。